Wariant BIZNES programu jest wariantem wielostanowiskowym polecanym dla małych firm które wymagają obsługi kilku magazynów reprezentujących filie, oddziały lub punkty sprzedaży detalicznej. Ze względu na posiadane funkcjonalności na programie WAPRO MAG BIZNES możemy pracować w jednym czasie na kilku stanowiskach (ilość potrzebnych nam stanowisk określamy licząc ile osób będzie miało możliwość pracy na programie w jednym czasie), obsługując wiele magazynów. 

Wariant PRESTIŻ programu jest wariantem wielostanowiskowym polecanym dla średnich firm posiadających wiele oddziałów, filii, sklepów. Ze względu na posiadane funkcjonalności na programie WAPRO MAG PRESTIŻ podobnie jak wariant BIZNES pozwala na pracę w jednym czasie na wielu stanowiskach, utworzenie dowolnej ilości użytkowników i nadanie im uprawnień. 

Wariant START programu jest najprostszym wariantem polecanym dla niewielkich firm prowadzących działalność handlową lub usługową. Ze względu na posiadane funkcjonalności na programie WAPRO MAG START możemy pracować w jednym czasie tylko na jednym stanowisku, obsługując tylko jeden magazyn. W programie jest utworzony tylko jeden użytkownik który ma dostęp do wszystkich funkcji programu i nie ma możliwości dodania kolejnych użytkowników, nawet jeśli w różnym czasie będzie pracowało na programie kilka osób. 

Wariant START programu WAPRO KAPER skierowany jest dla osób indywidualnych prowadzących działalność gospodarczą. Pozwala na obsługę jednego podmiotu, na jednym stanowisku – w programie dostępny jest tylko jeden użytkownik admin. Funkcjonalnościami wyróżniającymi ten wariant jest możliwość prowadzenia rozliczeń tylko jednego samochodu osobowego, prowadzenie ewidencji tylko do pięciu środków trwałych oraz brak możliwości prowadzenia obsługi wynagrodzeń oraz umów pracowników. W wariancie tym nie ma możliwości tworzenia deklaracji pracowników: PIT-11, PIT-40, PIT-4R, PIT-8AR, IFT-1/IFT-1R.

Wariant BIURO programu WAPRO KAPER skierowany jest dla biur księgowych rozliczających wiele firm. Zgodnie z warunkami licencji pozwala na obsługę nieograniczonej liczby firm. Program może być zainstalowany na wielu stanowiskach, możemy również utworzyć dowolną liczbę użytkowników programu i przypisać ich do grupy użytkowników, a także skonfigurować dla każdego z nich odpowiednie uprawnienia. Dodatkowe funkcjonalności które posiada ten wariant w przeciwieństwie do pozostałych wariantów to: eksport danych do arkusza kalkulacyjnego, eksport wydruków do formatu PDF, możliwość monitorowania zmian dokonanych w poszczególnych dokumentach oraz dodatkowe funkcje wspomagające pracę biura rachunkowego – a w szczególności ułatwiające zarządzanie e-Deklaracjami.

Wariant Biznes programu WAPRO FAKIR jest wariantem podstawowym przeznaczonym dla przedsiębiorstw handlowych, usługowych lub produkcyjnych, które nie potrzebują bardziej złożonych rozwiązań jak np. moduł obsługi miejsc powstawania kosztów. W wariancie tym istnieje możliwość prowadzenia do trzech firm w programie, jednak każda firma musi nabyć odrębną licencję.

Wariant BIZNES programu WAPRO KAPER skierowany jest dla przedsiębiorstw handlowych, usługowych lub produkcyjnych. Zgodnie z warunkami licencji pozwala na obsługę do trzech oddziałów firmy jeśli posiadają ten sam numer NIP lub trzech firm, jeśli każda z nich ma wykupioną oddzielną licencję. Program może być zainstalowany na wielu stanowiskach, możemy również utworzyć dowolną liczbę użytkowników programu. W odróżnieniu od wariantu podstawowego w wariancie tym istnieje możliwość rozliczania dowolnej liczby samochodów oraz środków trwałych. Od tego wariantu możliwa jest obsługa pracowników (obsługa wynagrodzeń, umowy zlecenie i umowy o dzieło, przelewy wynagrodzeń, tworzenie deklaracji PIT-11, PIT-40, PIT-4R, PIT-8AR, IFT-1/IFT-1R.

Wariant PRESTIŻ programu WAPRO ANALIZY jest wariantem zaawansowanym programu. Od wersji BIZNES różni się możliwością tworzenia widoków analitycznych które pozwalają na pominięcie generowania struktur OLAP oraz współpracą z programami WAPRO KAPER, WAPRO GANG oraz WAPRO BEST.

Wariant Biuro programu WAPRO FAKIR jest wariantem przeznaczonym dla biur rachunkowych, które nie potrzebują w swojej pracy bardziej rozbudowanych rozwiązań jak np. Moduł Powstawania Kosztów. W wariancie tym istnieje możliwość prowadzenia nieograniczonej liczby firm w programie, bez konieczności nabywania odrębnych licencji.

Wariant BIZNES programu WAPRO GANG skierowany jest dla przedsiębiorstw handlowych, usługowych lub produkcyjnych. Zgodnie z warunkami licencji pozwala na obsługę do trzech oddziałów firmy jeśli posiadają ten sam numer NIP lub trzech firm, jeśli każda z nich ma wykupioną oddzielną licencję. Program jest licencjonowany w zależności od ilości aktywnych pracowników w kartotece. Wariant BIZNES 30 pozwala na obsługę tylko do 30 aktywnych pracowników.